Các xét nghiệm trong phòng thí nghiệm có thể định danh trực tiếp các vi sinh vật [ví dụ, một cách trực quan, sử dụng kính hiển vi quan sát vi khuẩn mọc trên tiêu bản nuôi cấy] hoặc gián tiếp [ví dụ, xác định kháng thể với vi sinh vật]. Các loại xét nghiệm chung bao gồm
Kính hiển vi Kính hiển vi Soi trực tiếp có thể được thực hiện nhanh chóng nhưng độ chính xác phụ thuộc vào kinh nghiệm của người soi và chất lượng của tiêu bản. Các quy định thường hạn chế việc sử dụng kính hiển vi của... đọc thêm
Nuôi cấy Nuôi cấy Nuôi cấy là sự sinh trưởng của vi sinh vật trên hoặc trong môi trường dinh dưỡng hoặc chất lỏng; tăng số lượng các vi sinh vật để nhận dạng đơn giản hơn. Nuôi cấy cũng tạo điều kiện cho việc... đọc thêm
Xét nghiệm miễn dịch Các xét nghiệm miễn dịch cho bệnh truyền nhiễm Các xét nghiệm miễn dịch sử dụng một trong các cách sau: Antigen phát hiện kháng thể đối với mầm bệnh trong mẫu bệnh phẩm của bệnh nhân Kháng thể để phát hiện một kháng nguyên của mầm bệnh trong... đọc thêm [các phương pháp ngưng kết hạt latex, xét nghiệm miễn dịch enzym, Western blot, xét nghiệm kết tủa, và các xét nghiệm ngưng kết bổ sung]
Phương pháp định danh axit nucleic Các phương pháp nhận dạng dựa trên acid nucleic cho bệnh lý nhiễm trùng Nhận dạng dựa trên acid nucleic [phân tử] đã trở nên phổ biến ở các cơ sở lâm sàng; kết quả nhận dạng nhanh cho phép bệnh nhân được điều trị kháng sinh đặc hiệu và tránh điều trị kinh nghiệm... đọc thêm
Phương pháp định danh axit non nucleic Các phương pháp nhận dạng không dựa trên acid nucleic cho bệnh lý truyền nhiễm Một khi đã phân lập được căn nguyên từ môi trường nuôi cấy, phải định danh căn nguyên đó. Các phương pháp nhận dạng không dựa trên acid nucleic sử dụng các đặc tính kiểu hình [chức năng hoặc... đọc thêm
Nuôi cấy thường là tiêu chuẩn vàng để xác định vi sinh vật, nhưng kết quả có thể không có trong nhiều ngày hoặc vài tuần, và không phải là tất cả các mầm bệnh đều có thể nuôi cấy được, khi đó các xét nghiệm thay thế sẽ hữu ích. Khi một căn nguyên được nuôi cấy và định danh, phòng thí nghiệm cũng có thể lượng giá độ nhạy cảm Kiểm tra độ nhạy cảm Xét nghiệm độ nhạy cảm xác định tính dễ bị tổn thương của vi khuẩn đối với các thuốc kháng sinh bằng cách tiếp xúc một nồng độ vi sinh vật đã chuẩn hóa với các nồng độ đặc hiệu của kháng sinh... đọc thêm của vi sinh vật với kháng sinh. Đôi khi các phương pháp phân tử có thể được sử dụng để phát hiện gen đề kháng cụ thể.
Một số xét nghiệm [ví dụ, nhuộm Gram, nuôi cấy hiếu khí thường quy] có thể phát hiện được nhiều căn nguyên gây bệnh đa dạng. Xét nghiệm này được làm phổ biến khi nghi ngờ bệnh lý nhiễm trùng. Tuy nhiên, với xét nghiệm này một số mầm bệnh có thể bị bỏ sót, do đó bác sỹ lâm sàng phải cảnh giác với hạn chế của từng xét nghiệm với từng mầm bệnh nghi ngờ. Trong những trường hợp như vậy, bác sĩ lâm sàng nên yêu cầu các xét nghiệm cụ thể đối với các mầm bệnh nghi ngờ [ví dụ, phương pháp nhuộm đặc biệt hoặc môi trường nuôi cấy đặc biệt] hoặc khuyến cáo phòng thí nghiệm lựa chọn các xét nghiệm cụ thể hơn.