Cài đặt conda biopython

tôi đang làm việc trên cửa sổ. Tôi nghĩ rằng tôi đã cài đặt biopython với pip trong một môi trường conda cụ thể. Nguyên nhân với

_______0_______

nói

_______1_______

Tuy nhiên khi chạy trong pycharm

import biopython

Đưa ra lỗi

_______3_______

Tôi chắc chắn rằng nó đã được cài đặt đúng env vì tôi đã cài đặt các mô-đun python khác ở đó và chúng đã hoạt động. Đã thử thêm biến vào đường dẫn người dùng như được giải thích tại đây. https. //www. opentechguides. com/how-to/article/windows-10/113/windows-10-set-path. html nhưng nó vẫn không hoạt động

Trăn sinh học • 2. 4k lượt xem

THÊM NHẬN XÉT • 3. 4 năm trước bởi kỳ nhông ▴ 510

0

Vào chế độ chỉnh sửa

3. 4 năm trước

ram 37k

Tôi không nghĩ đó là import biopython, mà là import Bio

THÊM NHẬN XÉT • 3. 4 năm trước bởi Ram 37k

0

Vào chế độ chỉnh sửa

cũng không hoạt động với Bio. Ngay cả sau khi thêm vào đường dẫn của các biến hệ thống. C:\Users\Tania\.conda\envs\models\Lib\site-packages Còn thiếu thứ gì đó?

THÊM TRẢ LỜI • 3. 4 năm trước bởi kỳ nhông ▴ 510

0

Vào chế độ chỉnh sửa

Bạn có thể thực hiện các thí nghiệm sau và xem mọi thứ bị hỏng ở đâu không

1. Mở python trong models conda env, sau đó chạy import Bio để xem nó có hoạt động không
2. Nếu 1 hoạt động, hãy thử chạy python bên ngoài conda env, rồi import Bio
3. Nếu 2 hoạt động, thì hãy thử import Bio từ bên trong PyCharm

Các bước trên sẽ cho bạn biết liệu đó có phải là trăn không thể nhìn thấy vị trí mô-đun hay PyCharm đang hành động hài hước. Bước 1 xác nhận rằng bạn có cài đặt biopython đang hoạt động. Ngoài ra, từ mỗi cái, in ra

Requirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages (1.74)
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages (from biopython) (1.16.3)

2 để xem thư mục bạn đã thêm có hiển thị trong biến

Requirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages (1.74)
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages (from biopython) (1.16.3)

3 hay không

Cài đặt biopython từ kênh conda-forge có thể đạt được bằng cách thêm conda-forge vào kênh của bạn với

_______6_______

Khi kênh conda-forge đã được bật, có thể cài đặt biopython với

conda install biopython

1

_______7_______

hoặc với _______7_______2

_______10_______

Có thể liệt kê tất cả các phiên bản của biopython có sẵn trên nền tảng của bạn với

conda install biopython

1

_______12_______

hoặc với _______7_______2

_______14_______

Ngoài ra, _______7_______6 có thể cung cấp thêm thông tin

_______16_______

Giới thiệu về conda-forge

conda-forge là kênh conda do cộng đồng lãnh đạo gồm các gói có thể cài đặt. Để cung cấp các bản dựng chất lượng cao, quá trình này đã được tự động hóa trong tổ chức GitHub của conda-forge. Tổ chức conda-forge chứa một kho lưu trữ cho mỗi gói có thể cài đặt. Một kho lưu trữ như vậy được gọi là một nguồn nguyên liệu

Nguyên liệu được tạo thành từ công thức conda (hướng dẫn về nội dung và cách xây dựng gói) và các cấu hình cần thiết để xây dựng tự động bằng cách sử dụng các dịch vụ tích hợp liên tục có sẵn miễn phí. Nhờ dịch vụ tuyệt vời được cung cấp bởi Azure, GitHub, CircleCI, AppVeyor, Drone và TravisCI, có thể xây dựng và tải các gói có thể cài đặt lên kênh Anaconda-Cloud conda-forge cho Linux, Windows và OSX tương ứng

Để quản lý việc tích hợp liên tục và đơn giản hóa việc bảo trì nguyên liệu conda-smithy đã được phát triển. Sử dụng _______7_______7 trong kho lưu trữ này, có thể hiển thị lại tất cả các tệp hỗ trợ của nguyên liệu này (và. g. các tệp cấu hình CI) với ________7______8

Để biết thêm thông tin, vui lòng kiểm tra tài liệu conda-forge

thuật ngữ

nguyên liệu - công thức conda (nguyên liệu thô), tập lệnh hỗ trợ và cấu hình CI

conda-smithy - công cụ giúp sắp xếp nguyên liệu. Công dụng chính của nó là xây dựng các tệp CI

conda install biopython

9 và đơn giản hóa việc quản lý nhiều nguyên liệu

conda-forge - nơi nguyên liệu và lò rèn sống và làm việc để sản xuất thành phẩm (bản phân phối conda được xây dựng)

Cập nhật biopython-feedstock

Nếu bạn muốn cải thiện công thức biopython hoặc xây dựng phiên bản gói mới, vui lòng rẽ nhánh kho lưu trữ này và gửi PR. Sau khi gửi, các thay đổi của bạn sẽ được chạy trên các nền tảng phù hợp để người đánh giá có cơ hội xác nhận rằng những thay đổi đó dẫn đến một bản dựng thành công. Sau khi hợp nhất, công thức sẽ được xây dựng lại và tự động tải lên kênh conda-forge, sau đó các gói conda đã xây dựng sẽ có sẵn để mọi người cài đặt và sử dụng từ kênh conda-forge. Lưu ý rằng tất cả các nhánh trong conda-forge/biopython-feedstock đều được xây dựng ngay lập tức và mọi gói đã tạo đều được tải lên, do đó, PR phải dựa trên các nhánh trong nhánh và chỉ nên sử dụng các nhánh trong kho lưu trữ chính để xây dựng các phiên bản gói riêng biệt

Làm cách nào để cài đặt Biopython trong Conda?

Làm cách nào để cài đặt Biopython trong thiết bị đầu cuối?

Biopython có phải là một gói không?

Làm cách nào để cài đặt Biopython trong Mã VS?